干血斑用于HIV-1耐药基因型检测的研究

• 作者: 全宇 孙峰 廖玲洁 杨绍敏 苏斌 赵全壁 邢辉 邵一鸣 陈彬 陈曦 马鹏飞
• 来源期刊: 中华预防医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: HIV-1 干血斑 基因型耐药性检测 聚合酶链反应
• 年，卷（期）: 2010,（11）
• 页码范围: 993-998
• 分类号: R1
• 字数: 4092字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2010.11.009

摘要

目的 通过干血斑样本与血浆、全血的HIV-1基因型耐药性检测结果比较,探讨干血斑样本应用于我国患者HIV-1耐药性检测及监测的可行性.方法 选择来自安徽(10例)、云南(13例)、湖南(6例)和新疆维吾尔自治区(10例)4省(自治区)共39例AIDS患者,这些患者感染的HIV-1流行株覆盖中国主要的流行亚型(B、CRF01 AE、CRF07_BC),同时对同一患者的血浆、全血及干血斑3种类型的样本应用实验室自建的套式PCR方法扩增HIV的pol基因区,通过美国斯坦福大学的HIV耐药数据库进行耐药程度判别并比较三者的耐药性结果.结果 干血斑、全血与血浆样本相比总扩增成功率分别为95%(37/39)、92%(36/39)及100%(39/39),各亚型样本基因序列的3种样本的一致性均高于99%,同时干血斑样本的耐药性检测结果与血浆相比一致性为86%(31/36),突变位点不一致的主要原因为混合碱基导致.结论 综合PCR扩增效果及序列分析差异等因素,干血斑样本可以反映出耐药的整体流行趋势,用于我国HIV-1患者的耐药检测及监测值得推广.