猪CuZnSOD基因的克隆、表达及功能分析

• 作者: 崔景香 曾勇庆 杜金芳 杨伦 胡艳霞 陈伟 陈其美
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 CuZnSOD 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2010,（10）
• 页码范围: 1037-1042
• 分类号: S8
• 字数: 4625字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2010.01037

摘要

为了进一步了解和认识CuZnSOD基因的结构和功能,揭示CuZnSOD对猪抗氧化机能的影响,寻找与肉质性状相关联的分子标记,文章采用RACE(Rapid amplification of cDNA end)方法,对莱芜猪CuZnSOD基因cDNA进行克隆测序,分析其结构和功能,并用Real-timePCR检测CuZnSOD基因的表达.结果表明,CuZnSOD基因cDNA序列全长658 bp(GenBank登录号:GU944822),包含76 bp的5'UTR和120 bp的3'UTR序列.全部CDS序列462 bp,编码153个氨基酸,分子量为15.9 kDa,等电点为6.03.CuZnSOD基因编码的氨基酸序列中,第3氨基酸残基处存在1个O-糖基化位点,第86氨基酸残基处存在1个N-糖基化位点.二级结构中α螺旋仅占1.31%.在进化过程中高度保守,与人、牛、小鼠和褐鼠的编码区同源性分别为87.74%、87.66%、83.44%和83.23%;氨基酸序列同源性分别为90.26%、94.12%、92.21%和91.50%.CuZnSOD存在典型的金属结合配体结构域(GFHVHQFGDNT).基于蛋白序列所构建的分子进化树表明猪与牛的亲缘关系最近.在mRNA水平上,CuZnSOD是一个广谱表达基因,在大脑、心脏、脾脏、肝脏、肾脏、肺、大肠、小肠、脊髓,肌肉、背膘和胃中都能检测到,其在肾脏,小肠和肺中表达量较高,在心脏和肌肉组织中表达量较低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾勇庆	山东农业大学动物科技学院	108	1583	23.0	36.0
2	陈其美	山东农业大学动物科技学院	14	318	10.0	14.0
3	陈伟	山东农业大学动物科技学院	61	761	15.0	25.0
4	胡艳霞	山东农业大学动物科技学院	3	25	3.0	3.0
5	杨伦	山东农业大学动物科技学院	5	37	5.0	5.0
6	杜金芳	山东农业大学动物科技学院	5	77	4.0	5.0
7	崔景香	山东农业大学动物科技学院	8	96	6.0	8.0