大肠杆菌ERIC-PCR分子分型方法的建立及其初步应用

• 作者: 张辉 杨振泉 王冉 赵隽 魏瑞成
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大肠杆菌 ERIC-PCR 分子分型
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 页码范围: 1098-1103
• 分类号: S182
• 字数: 4009字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2010.05.036

摘要

为建立高效、敏感的肠杆菌科基因间重复一致序列PCR(ERIC-PCR)的分子分型方法,该研究提取大肠杆菌基因组DNA,以此为模板建立和优化ERIC-PCR分型体系,并采用ERIC-PCR方法对62株大肠杆菌进行分子分型和遗传相似性统计分析.结果显示从提取的大肠杆菌基因组中能够扩增到 2～8条DNA片段,且大部分片段在 100 bp至 2 000 bp之间.通过4因素3水平正交试验,建立了较为稳定的ERIC-PCR分型方法.利用ERIC-PCR方法可将62株菌分为20型,其中以A型为优势菌群.遗传相似性结果表明,各菌株之间遗传相似性有较大的变化,但部分菌株高度同源.聚类分析表明,ERIC-PCR的分辨率系数为0.937,具有较高的分辨能力.表明应用ERIC-PCR分型技术在分子水平上对大肠杆菌进行鉴别和分型,具有简便和分辨力高等优点,能够对病原进行溯源分析,在大肠杆菌的分子流行病学研究中具有广泛的应用前景.