HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QM/MM研究

• 作者: 张少龙 张庆刚 张玉新
• 来源期刊: 山东科学
• 学科: 化学
• 关键词: hybrid QM/MM方法 AM1方法 W301水分子 结合自由能 MM-GBSA
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: O641.12
• 字数: 2910字
• 语种: 中文

摘要

对HIV-1蛋白酶与抑制剂2AH和4AH结合的两个复合物体系进行了水溶液环境下量子力学分子力学混合方法(hybrid QM/MM)的1ns分子动力学模拟,用MM-GBSA方法得到桥接水分子W301与HIV-1蛋白酶和抑制剂结合体的结合自由能分别为-24.93 kJ/mol和-20.29 kJ/mol,表明W301在抑制剂和HIV-1蛋白酶结合的过程中起到了不能被忽略的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张庆刚	山东师范大学物理与电子科学学院	71	240	8.0	11.0
2	张少龙	山东师范大学物理与电子科学学院	29	118	6.0	9.0
3	张玉新	山东师范大学物理与电子科学学院	1	7	1.0	1.0