甘蔗液泡ATP酶C亚基基因克隆及序列分析

• 作者: 张树珍 杨本鹏 王俊刚 许志宇
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蔗 糖分积累 V-ATPase RACE 序列分析
• 年，卷（期）: 2010,（9）
• 页码范围: 82-86
• 分类号: S5
• 字数: 3963字
• 语种: 中文

摘要

根据筛选文库时获得的EST序列信息,利用RACE技术分离了一个甘蔗ATP酶C亚基基因,命名为ShVHA-C.该基因cDNA全长1 312 bp,舍有1 056 bp的完整阅读框架,编码351个氨基酸.序列比对及结构预测分析表明,ShVHA-C编码的氨基酸序列与水稻、小麦、苜蓿、绿豆和蓖麻中相应基因氨基酸序列的一致性分别达到94.10%、93.22%、91.15%、91.15%和91.74%,与水稻一致性最高.在整个二级结构中,含有233个α-螺旋(alpha helix),占66.38%;舍有5个延伸链(extended strand),占1.42%;含有113个无规则卷曲(random coil),占32.19%.此蛋白不具有导肽.整个多肤链表现为亲水性,没有明显的疏水区域,初步认为甘蔗ShVHA-C编码蛋白是亲水性蛋白.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨本鹏	中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带生物技术重点开放实验室	40	669	13.0	25.0
2	张树珍	中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带生物技术重点开放实验室	79	1288	20.0	33.0
3	王俊刚	中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带生物技术重点开放实验室	18	261	7.0	16.0
4	许志宇	中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带生物技术重点开放实验室	1	3	1.0	1.0