拟黑多刺蚁雌激素相关受体基因cDNA的克隆及生物信息学分析

• 作者: 侯兰新 奚耕思 欧阳霞辉 赵有红
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟黑多刺蚁 pvERR 分子克隆 生物信息学分析 蛋白质结构预测
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 页码范围: 587-595
• 分类号: Q966
• 语种: 中文

摘要

雌激素相关受体(estrogen related receptors,ERRs)能够直接与类固醇激素受体共激活子(steroidhormone receptor coactivator,SRC)结合,激活靶基因的表达,与众多生理和发育过程有关.采用RT-PCR、RACE等方法从拟黑多刺蚁Polyrhachis vicina Roger克隆得到了雌激素相关受体基因的cDNA克隆,命名为pvERR(GenBank登录号为EF474463),并采用生物信息学方法对其cDNA和编码的蛋白质的理化性质、蛋白质二级及三级结构、分子系统进化关系等进行了预测和推断.结果表明:pvERR基因cDNA全长1 935 bp,包含一个1 305 bp的开放阅读框、245bp的5'-UTR和385 bp的3'UTR,编码一个由434个氨基酸组成的蛋白质.pvERR的配体结合区(ligand binding domain,LBD)主要由两个β折叠和11个α螺旋(H1,H3～H12,缺少H2)构成,这与哺乳类动物已知晶体结构的ERRγ的配体结合区结构非常相似.pvERR氨基酸序列与其他昆虫ERRs氨基酸序列同源性很高,它与西方蜜蜂Apis mellifera雌激素相关受体amERR氨基酸序列相似性达到89.9%;在进化关系上,pvERR与人类Homo sapiens ERRs的关系比果蝇Drosophila melanogaster雌激素相关受体dERR与人类的更近.本文可为进一步研究pvERR在昆虫发育中的功能提供有价值的信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	奚耕思	陕西师范大学生命科学学院	122	624	12.0	19.0
2	侯兰新	西北民族大学生命科学与工程学院	26	70	4.0	7.0
3	欧阳霞辉	西北民族大学生命科学与工程学院	23	22	3.0	3.0
5	赵有红		20	40	4.0	5.0