源于大豆EST的花生属(Arachis)同源SSR标记的开发及利用

• 作者: 刘海燕 周桂元 李少雄 梁炫强 洪彦彬 温世杰 陈小平
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 大豆 花生属(Arachis) EST SSR
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 410-421
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.00410

摘要

通过拼接394370条大豆EST共获得82 614条Uni-EST,其中2082条包含2191个SSR位点,平均每22.96kb EST出现1个SSR.二核苷酸重复在大豆EST-SSR中所占比例最大(63.5%),其次是三核苷酸重复(30.9%);AG/CT在SSR基序(motif)中出现频率最高(35.8%),AT/AT(25.4%)次之.2082条SSR-EST共设计引物685对,其中582对在4个大豆品种中得到有效扩增,98对检测出多态性.582对可扩增引物在花生属中的可转移性分析表明,大豆EST-SSR在花生属9大区组间的可转移性有所差异(12.4%～15.7%),匍匐区组最高,大根区组最低,平均为14.2%.79对可转移性同源标记在花生区组中的多态性分析表明,69个SSR在10个野生种间检测出多态性,仅5个在22个栽培品种中具多态性.对引物ES-105在大豆和花生区组中的扩增产物测序结果显示,两个大豆品种间仅SSR位点存在3个AT重复差异,其余序列均一致,而大豆与花生区组间的扩增产物在序列上存在较大差异,花生区组除缺失SSR位点外,侧翼序列也存在频密的插入/缺失和置换.研究结果表明,通过大豆EST开发花生属同源SSR标记具可行性.作为有功能的分子标记,大豆EST-SSR在花生区组内多态性丰富,可直接用于大豆-花生比较基因组研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李少雄	广东省农业科学院作物研究所	54	542	14.0	21.0
2	梁炫强	广东省农业科学院作物研究所	111	1027	19.0	27.0
3	周桂元	广东省农业科学院作物研究所	80	854	17.0	26.0
4	洪彦彬	广东省农业科学院作物研究所	32	412	12.0	19.0
5	陈小平	广东省农业科学院作物研究所	23	279	8.0	16.0
6	刘海燕	广东省农业科学院作物研究所	32	327	10.0	17.0
7	温世杰	广东省农业科学院作物研究所	20	227	6.0	15.0