天津地区结核分枝杆菌可变串联重复序列多态性研究

• 作者: 吴振萍 巨韩芳 王撷秀 穆成 谢彤 赵德福 赵慧
• 来源期刊: 天津医药
• 关键词: 分枝杆菌,结核 串联重复序列 基因型 多态现象,遗传 流行病学,分子 天津
• 年，卷（期）: 2010,（11）
• 页码范围: 940-943
• 分类号: R3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0253-9896.2010.11.004

摘要

目的:分析天津地区流行结核分枝杆菌(MTB)基因组中分布的可变串联重复序列(VNTR)拷贝数目多态性,探讨不同MTB菌株分辨能力强的VNTR基因分型方法.方法:根据VNTR位点PCR扩增产物片段长度分析临床分离的102株MTB菌基因组中22个VNTR位点中重复序列拷贝数目,使用Hunter-Gaston分辨指数(H)评估各个VNTB位点的多态性和VNTR基因分型方法对菌株的综合辨别能力.结果:13个VNTR位点对不同MTB菌株具有较强的分辨能力,其分辨指数达0.9963.其中QUB11b、11a、18、26,MIRU-26、31和Mtub21的多态性较好(H值为0.442～0.699);MIRU-10、27、39、40,QUB1895和ETR-A位点的多态性尚可(H值为0.203～0.316);而MIRU-2、4、16、20、23、24,QUB1451,ETR-B和C的多态性差(H值为0.000～0.150),其中MIRU-2、20、24和QUB1451在北京家族菌株中没有多态性(H=0).结论:选择多态性好的位点组合可以有效地区分不同的MTB北京家族菌株,建立起菌株分辨能力强的VNTR分型方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王撷秀		11	63	4.0	7.0
2	谢彤		8	36	3.0	6.0
3	巨韩芳		4	16	2.0	4.0
4	赵德福		1	1	1.0	1.0
5	穆成		4	7	2.0	2.0
6	赵慧		3	4	1.0	2.0
7	吴振萍		1	1	1.0	1.0