[目的]对新疆梨的分类地位提供DNA水平上的依据.[方法]以健康植株新梢上的成熟叶片为材料,采用CTAB法提取DNA.利用AFLP分子标记技术,通过统计软件SPSS for Windows计算供试材料之间的欧氏距离,利用离差平方和法进行聚类分析,输出欧氏距离表并产生聚类树状图,对新疆梨进行分类研究.[结果]当阈值为15时,新疆梨品种兰州长把和花长把首先聚在一起,然后再与西洋梨品种巴梨、红巴梨、红茄、茄梨、保利阿斯卡、朱丽比恩和新疆梨品种其力阿木提聚在一起.7个新疆梨品种中,群体内品种之间欧式距离为2.646~10.050,与砂梨系统、西洋梨系统、白梨系统、秋子梨系统各品种间最小欧式距离分别为7.746、7、7.746、7.810、8.165.[结论]新疆梨与西洋梨系统有较近亲缘关系.