日本沼虾微卫星引物筛选及群体遗传多样性分析

• 作者: 丁怀宇 冯建彬 华雪铭 李家乐 马克异
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 日本沼虾 微卫星引物 筛选 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 页码范围: 688-695
• 分类号: Q346+.5|S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3727/SP.J.1231.2010.06708

摘要

采用(CI)15、(CA)15两种生物素标记及磁珠富集法构建了太湖日本沼虾基因组微卫星富集文库.120个微卫星克隆中83个位点的核心序列重复在10个以上,长度介于191～580 bp,平均为311 bp;重复类型中,(CA/GT)n及(AG/TC)n分别占59.09%及20.45%,还检测到(GC)n(AAG)n、(ACAA)n和(GGCAGA)n等17种类型,包括25.75%完美型,20.45%非完美型和53.80%复合性.用其中12条微卫星引物扩增吴江、滨湖、宜兴和吴兴4个群体240个个体的基因组DNA,各位点表现出较高的遗传多样性,除Mni86、Mni103和Mni114外,其它群体位点大都表现出显著的杂合子缺失,4个群体的遗传分化为低度分化(FST<0.05),4个群体中97.58%遗传变异存在于群体内,仅有2.42%的遗传变异来自于群体之间;吴江和吴兴群体亲缘关系最近,与宜兴和滨湖群体亲缘关系渐远.