西伯利亚鲟Sox9基因cDNA全长克隆、序列分析及其表达检测

• 作者: 宋佳坤 施志仪 程千千 轩兴荣
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 西伯利亚鲟 Sox9 cDNA全长 cDNA末端快速扩增 表达检测
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 页码范围: 664-672
• 分类号: Q786|S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2010.06622

摘要

为了研究Sox9基因在西伯利亚鲟侧线神经发育过程当中所起的调控作用.本研究利用RT-PCR和RACE方法获得了西伯利亚鲟Sox9基因eDNA全长序列,经序列分析表明,所克隆Sox9 cDNA全长为1 409 bp,包括开放阅读框(open reading frame,ORF)1 083 bp,5'端非翻译区(untranslated region,UTR)19 bp和3'端非翻译区(untranslawM region,UTR)307 bpol 083 bp的ORF共编码360个氨基酸,相对分子质量为4l 221.7 U.序列分析表明,其与施氏鲟的亲缘关系较近,其次是斑马鱼.经实时荧光定量PCR技术对西伯利亚鲟Sox9基因在各组织以及在胚胎发育各时期中的相对表达量检测发现,Sox9在西伯利亚鲟中的表达具明显的组织差异性和时间差异性.其中,在肝,肾,肌肉,胰中的相对表达量较低.然而,大脑组织中的表达量与以上4个组织相比,处于极高水平,达到胰脏中相对表达量8.9倍,达到表达量最低点肾脏中的近21倍.在胚胎发育的不同阶段,Sox9均有表达.在原肠期、神经胚期及视泡形成期,Sox9基因的表达量均较高,特别是在原肠期其表达量达到西伯利亚鲟整个胚胎发育期的最高点,相当于表达量最低点心脏形成期的1.9倍.在神经胚期和视泡形成期,Sox9的相对表达量也相对处于较高水平,仅比原肠期略低,其相对表达量是心脏形成期1.2倍和1.4倍.本研究将为今后深入研究Sox9基因在西伯利亚鲟侧线神经节分化发育、细胞迁移过程中所起的调控作用积累资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	施志仪	上海海洋大学水产与生命科学学院	48	217	9.0	11.0
2	轩兴荣	上海海洋大学水产与生命科学学院	12	28	3.0	4.0
3	程千千	上海海洋大学水产与生命科学学院	9	45	5.0	6.0
4	宋佳坤	上海海洋大学水产与生命科学学院	18	98	6.0	9.0