抗砷细菌arsH基因多样性分析

• 作者: 刘可可 历丽 夏金兰 徐爱玲 聂珍媛
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 抗砷基因(arsH) 源环境 系统发育分析 水平基因转移 稀释曲线
• 年，卷（期）: 2010,（9）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1650-1653
• 分类号: Q939.0.1
• 语种: 中文

摘要

目的:研究含arsH基因抗砷微生物的多样性.方法:从NCBI数据库中收集95条arsH基因序列,通过Clustal W 1.83,Mega 3.0、DOTUR软件分别对95条序列进行多序列比对、构建系统发育树、稀释曲线等分析.结果:这些包含arsH基因的菌株分别归属于α-变形杆茵纲(约40%),γ-变形杆茵纲(35%),β-变形杆茵纲(22%),以及蓝细茵(3%).在涉及的14个科当中,Rhizo-biales所占比例最高(29%);Burkholderiales:次之(22%);Pseudomonadales和Enterobaeteriales占较少的比例,分别为18%和11%.针对数据库已有数据分析显示,含有arsH基因的微生物约89%分布在陆地,6%分布在海洋,还有5%在陆地海洋均有分布.陆地中占总比例的24%分布于土壤中;21%分布于矿山、地下水、气田、油田、受污染环境、矿坑水、淡水等环境中;约1%为植物共生菌,26%为病原微生物.结论:该基因在不同的物种之间存在水平基因转移,目前对于含arsH基因的抗砷微生物的筛选和分离工作还远远不够.