识别表达不稳定的基因

• 作者: 徐德昌 戴国骏 李建中 杨昆
• 来源期刊: 软件学报
• 学科: 工学
• 关键词: 微阵列 基因表达数据分析 整数规划 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2010,（9）
• 页码范围: 2148-2160
• 分类号: TP391
• 字数: 11015字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1001.2010.03796

摘要

提出集成分析来自相同研究问题的不同数据集来识别表达不稳定的基因.把这一问题形式化为一个非线性整数规划问题,三个启发式的算法被提出来求解这一优化问题;进一步地设计了一个统计量来度量基因的不稳定表达程度.提出的方法应用于两个真实数据,实验结果显示:所识别的不稳定基因在两个数据中的表达不一致;利用表达不稳定基因可以提高差异表达基因的筛选结果,而去除表达不稳定基因可以有效地提高微阵列数据分类.实验结果表明,提出的方法是有效的,并且表达不稳定基因可以为微阵列数据分析提供有价值的信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐德昌	哈尔滨工业大学计算科学与技术学院	68	602	15.0	20.0
2	李建中	哈尔滨工业大学计算科学与技术学院	237	6003	33.0	72.0
3	戴国骏	杭州电子科技大学计算机学院	47	456	12.0	20.0
4	杨昆	杭州电子科技大学计算机学院	15	73	4.0	8.0