罗非鱼颗粒蛋白前体cDNA序列与表达分析

• 作者: 余晓丽 李超 梁万文 王瑞 甘西 陈明 黄婷 黄钧
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 罗非鱼 实时定量PCR 抗病育种 PGRN 基因表达分析
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 页码范围: 949-955
• 分类号: Q781
• 字数: 4257字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1035.2010.00949

摘要

颗粒蛋白前体(Progranulin,PGRN)在先天免疫反应调控及个体生长发育过程中均有重要作用.通过对罗非鱼外周血白细胞全长cDNA文库筛选得到的序列进行生物信息学分析,获得罗非鱼Pgrn全长cDNA序列(GenBank登录号为GQ241348).该cDNA克隆总长843 bp,包含一个完整的开放阅读框,编码206个氨基酸,其中推定信号肽20个氨基酸,两个GRN重复单位均56个氨基酸.研究采用实时定量PCR(Real-time RT-PCR)方法对感染海豚链球菌后奥尼罗非鱼、尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼和吉富罗非鱼4种组织(脑、肝脏、脾脏和头肾)Pgrn mRNA表达情况进行分析.结果显示,Pgrn mRNA在攻毒后4种罗非鱼4种组织中表达均有上调趋势,并且在脾中的表达量最高,提示PGRN在鱼类先天免疫反应调控中起重要作用.另外,奥尼罗非鱼在感染海豚链球菌后6h的脑和肝脏、6h和12h的脾脏和头肾中Pgrn mRNA表达均下调,然后表达升高,这种表达变化在其他三种鱼中不明显,这也许是奥尼罗非鱼抗病力较强的一个原因.研究为从分子水平探讨PGRN在罗非鱼先天免疫反应中的作用机制提供了数据,也为罗非鱼的抗病选育提供了参考分子标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁万文		36	392	11.0	18.0
2	陈明		26	280	9.0	16.0
3	余晓丽		28	249	9.0	15.0
4	甘西		52	550	13.0	22.0
5	黄钧	广西大学动物科学技术学院	59	739	15.0	26.0
6	李超	广西大学动物科学技术学院	18	102	4.0	10.0
7	黄婷		11	56	6.0	7.0
8	王瑞		12	46	4.0	6.0