三角帆蚌GPX基因cDNA全序列的克隆及其编码蛋白的结构分析

• 作者: 李家乐 李西雷 汪桂玲 袁一鸣
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 三角帆蚌 GPX基因 RACE 编码蛋白
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 360-368
• 分类号: S9
• 字数: 7131字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2010.00360

摘要

根据本实验室构建的三角帆蚌cDNA文库中已标注的EST序列, 利用cDNA末端快速扩增法(RACE)克隆了三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathione peroxidase, GPX)基因cDNA全序列.序列分析表明, 该基因cDNA序列全长1286 bp, 包括5'端非翻译区(Untranslated Region) 39 bp、3'端非翻译区659 bp和开放阅读框(Open reading frame, ORF)588bp, 共编码195个氨基酸, 分子量约为22.2 kDa, 理论等电点为8.44, 属于含硒类GPX.该氨基酸序列具有GPX所有亚型中均高度保守的3个环状结构, 对酶的三级结构起稳定作用.在线分析结果表明: GPX的氨基酸序列不存在明显的疏水区, 也不存在信号肽序列.氨基酸相似性对比结果显示, 三角帆蚌GPX氨基酸序列与脊椎动物GPX-2及GPX-1的序列相似度较高, 为73.1%-80.8%, 与其他型GPX相似度较小, 相似度低于60%.构建的系统进化树显示三角帆蚌GPX与其他几种鱼类GPX聚为一类, 与其他已发表的几种软体动物GPX相距较远, 推测本实验克隆的三角帆蚌GPX基因和已发表的软体动物不属于同一种GPX类型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汪桂玲	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	33	196	9.0	12.0
2	李西雷	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	6	42	4.0	6.0