应用8标iTRAQ技术结合2D LC-MS/MS分析大鼠再生肝的差异蛋白质组

• 作者: 刘晓慧 张一甫 林成招 秦兆宇 贺福初
• 来源期刊: 分析测试学报
• 学科: 化学
• 关键词: iTRAQ 2D LC-MS/MS 肝脏再生 差异蛋白质组
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 421-429
• 分类号: O657.63|O629.73
• 字数: 4782字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-4957.2010.05.001

摘要

首次应用8标iTRAQ(Isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术结合2D LC-MS/MS(Two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry),以部分肝切除的大鼠为模型,全面分析了再生早期(6、12 h)、中期(24、48 h)和晚期(72、120 h)肝脏蛋白质的表达差异.共鉴定357种蛋白质,6个时间点共有60种蛋白质的表达量与对照组(手术切下的正常肝组织)有显著差异.其中,ADH1(Alcohol dehydrogenase 1)和PRDX1(Peroxiredoxin 1)等的表达变化趋势与已有报道相同,GO(Gene ontology)的蛋白质功能注释提示ADH1、CAT(Catalase)、ENO1(Enolase 1)和APOA1(Apolipoprotein A- Ⅰ)等可能通过影响细胞凋亡和能量供给等方式参与肝再生调控.聚类分析表明,术后12 h和24 h蛋白质的整体表达模式相似,6 h与此二者相近,48 h和72 h相似,而120 h与这些时间点相差最远.该研究验证了8标iTRAQ是并行处理多组样本的有效技术,适合于生理和病理过程多时间点蛋白质组的定量差异分析,可以监控关键分子的动态变化,更易发掘重要的调控靶点分子.该文为进一步探讨肝再生机理提供了有价值的线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贺福初		10	209	6.0	10.0
3	刘晓慧	复旦大学生物医学研究院蛋白质组研究中心	6	26	3.0	5.0
4	张一甫		1	13	1.0	1.0
5	秦兆宇		1	13	1.0	1.0
6	林成招		1	13	1.0	1.0