基于线粒体D-loop区与COI基因序列比较分析养殖与野生银鲳群体遗传多样性

• 作者: 侯俊利 彭士明 施兆鸿
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 银鲳 线粒体DNA 养殖 野生 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 页码范围: 19-25
• 页数: 7页
• 分类号: Q346|S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2010.06384

摘要

运用线粒体D-loop区与COI基因片段序列比较分析了养殖与野生银鲳群体的遗传多样性.研究结果显示,线粒体D-loop区片段中,A、T、C与G 4种核苷酸的平均含量分别为40.00%、30.55%、16.75%和12.70%,A+T的含量为70.55%,明显高于G+C的含量.COI基因片段中,A、T、C和G的平均含量分别为25.85%、33.90%、21.30%和18.85%,A+T的含量(59.75%)同样高于G+C的含量.基于D-loop序列分析所得出的两群体总的变异位点、单倍型数、单倍型多样性、核苷酸多样性及平均核苷酸差异数分别为19、15、0.895、0.007和2.505.基于COI基因所得出的两群体总的变异位点、单倍型数、单倍型多样性、核苷酸多样性及平均核苷酸差异数分别为33、17、0.713、0.004和2.239.基于线粒体D-loop区与COI基因片段序列的研究结果均显示,养殖银鲳群体的遗传多样性低于野生群体的遗传多样性.养殖群体基于线粒体D-loop区与COI基因片段分析得出的单倍型多样性分别为0.562与0.571,野生群体基于线粒体D-loop区与COI基因片段分析得出的单倍型多样性分别为0.891与0.801.基于D-loop序列的分子方差(AMOVA)分析结果显示,养殖与野生银鲳群体间具有较高的遗传分化,而基于COI基因片段AMOVA分析结果显示,两群体间并无明显的遗传分化.研究表明,线粒体D-loop区与COI基因均可作为检测银鲳群体遗传多样性的有效标记,但线粒体D-loop区作为反映银鲳群体间遗传多样的敏感度要高于COI基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	侯俊利	中国水产科学研究院东海水产研究所	15	232	7.0	15.0
2	施兆鸿	中国水产科学研究院东海水产研究所	96	1874	26.0	39.0
3	彭士明	中国水产科学研究院东海水产研究所	72	1102	19.0	31.0