基于28S rDNA部分序列的石磺科系统发育研究

• 作者: 吴文健 沈和定 王玲 陈诚 魏峦峦
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 28S rDNA D区 石磺 系统发育
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 172-178
• 分类号: Q94
• 字数: 4815字
• 语种: 中文

摘要

采用PCR技术对采集自中国大陆沿海5地8个群体石磺的28S rDNA部分序列进行扩增.将测序结果与GenBank中的另外3条石磺科贝类的对应序列一起,以小鼠28S rDNA基因序列进行参照,截取D1、D2、D3区域,拼接后进行比对分析.在获得的689 bp的序列中,有76个变异位点,28个简约信息位点,A+T平均含量为30.9%,C+G平均含量为69.0%.以分类关系较近的菊花螺科(Siphonaria alternate)为外群,用NJ、MP、ML和贝叶斯法构建分子系统树.4种方法得到的进化树拓扑结构很相似,得到的结果也与沈和定提出的中国大陆沿海石磺科贝类可划分为Peronia、Platevindex、Onchidium、Paraoncidium 4个属的观点基本一致.同时,28S rDNA部分序列的系统分析还显示,4个属中Peronia属与Paraoncidium属亲缘关系较近,Platevindex属与Onchidium属关系比较近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈和定	上海海洋大学水产与生命学院	71	477	13.0	17.0
2	陈诚	上海海洋大学水产与生命学院	6	44	4.0	6.0
3	吴文健	上海海洋大学水产与生命学院	5	38	4.0	5.0
4	魏峦峦	上海海洋大学水产与生命学院	5	39	4.0	5.0
5	王玲	上海海洋大学水产与生命学院	4	43	3.0	4.0