中国龙虾微卫星标记的筛选及遗传多样性分析

• 作者: 刘丽 刘楚吾 郭昱嵩 黎锦明
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 中国龙虾 基因组文库 微卫星标记 遗传多样性 引物筛选
• 年，卷（期）: 2010,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 737-743
• 分类号: S9
• 字数: 4962字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2010.00737

摘要

文章以M13通用引物和重复序列(CT)15、(AT)15引物,利用PCR法对中国龙虾(Panulirus stimpsoni Hoehuis)部分基因组DNA文库进行筛选.共获得78个微卫星序列,分别分布于55个阳性重组克隆中,其中完美型(perfect)共50个,占64%;非完美型(imperfect)3个,占3.8%;混合完美型(compound perfect)6个,占7.7%;混合非完美型(compound imperfect),19个,占24.5%.根据微卫星序列,设计并筛选出15对微卫星多态性引物,对中国龙虾的群体进行了遗传多样性分析.获得3～12个等位基因,等位基因大小在78-425 bp之间,基本符合引物设计的理论长度.期望杂合度范围为0.48～0.87,平均值为0.71,表明中国龙虾基因组微卫星具有较高的杂合度与遗传多样性.15个微卫星位点的PIC值从0.44到0.84,平均值为0.60,说明这些微卫星位点在中国龙虾基因组中包含丰富的遗传信息,合适用于中国龙虾的各种分子标记及遗传学分析和应用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘楚吾	广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室	105	1315	18.0	30.0
2	郭昱嵩	广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室	34	378	9.0	18.0
3	刘丽	广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室	70	595	13.0	21.0
4	黎锦明	广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室	3	17	2.0	3.0