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棉纤维伸长阶段上、下调基因及相关通路的分析
棉纤维伸长阶段上、下调基因及相关通路的分析
作者:
冷雪
杜雄明
贾银华
原文服务方:
作物学报
基因通路图
脂肪酸
cDNA芯片
摘要:
棉花纤维细胞是研究细胞发育机制的理想材料,陆地棉Ligon lintless(Li1)是单基因显性超短纤维突变体,其性状表现为长纤维极度缩短,分离得到的野生型(li1)纤维发育正常.本实验通过cDNA芯片的方法对2个材料进行比较分析,采集开花前1 d到开花后7 d材料,检测到多个上调和下调基因,选择2个基因(CIPK和XET)进行RT-PCR和qRT-PCR的芯片验证.应用MAS(molecular analysis system)系统进行GO功能注释和Pathway的分析表明,这些差异表达基因参与脂肪酸代谢(fatty acid metabolism)、甘油脂代谢(glycerolipid metabolism)以及碳同定(reductive carboxylate cycle)等多个代谢途径.这些基因在突变体Li1中的异常表达可能导致细胞中脂肪酸和脂肪含量变化,影响棉纤维细胞的正常发育.
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基因组学
蛋白组学
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功能基因
综述
棉纤维发育相关基因时空表达与纤维品质的关联分析
棉花
纤维品质
棉纤维发育相关基因
荧光实时定量PCR
两个棉纤维发育相关基因的克隆与特征分析
棉花
纤维突变体
DDRT-PCR
谷氨酸脱羧酶
质子焦磷酸酶
内容分析
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文献信息
篇名
棉纤维伸长阶段上、下调基因及相关通路的分析
来源期刊
作物学报
学科
关键词
基因通路图
脂肪酸
cDNA芯片
年,卷(期)
2010,(11)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
研究方向
页码范围
1891-1901
页数
分类号
S5
字数
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1006.2010.01891
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
贾银华
中国农业科学院棉花研究所
11
127
6.0
11.0
2
杜雄明
中国农业科学院棉花研究所
57
1053
18.0
31.0
3
冷雪
中国农业科学院棉花研究所
13
62
4.0
7.0
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节点文献
基因通路图
脂肪酸
cDNA芯片
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
作物学报
主办单位:
中国作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0496-3490
CN:
11-1809/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1950-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
5614
总下载数(次)
0
总被引数(次)
197718
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