胃癌临床病理分期相关基因MGP的发现及其表达验证

• 作者: 于颖彦 刘炳亚 张佳年 朱正纲 蒋金玲 计骏 郭晓波 郭磊
• 来源期刊: 中华病理学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 胃肿瘤 寡核苷酸序列分析 数据收集 预后 Matrix gla protein
• 年，卷（期）: 2010,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 436-441
• 分类号: R73
• 字数: 4756字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0529-5807.2010.07.002

摘要

目的 通过对基因芯片数据库中一组大样本胃癌表达谱芯片的数据挖掘分析,筛选并验证与临床病理分期及预后密切相关的基因.方法 检索基因表达谱芯片数据库,对其中符合分析要求(大样本、病理分型、临床病理分期以及随访资料齐全)的胃癌表达谱芯片数据进行再挖掘分析.利用基因芯片显著性差异基因分析(SAM)方法筛选出不同临床病理分期的差异基因,并通过逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)、即时荧光定量PCR、Western blot方法验证胃癌细胞株及54例胃癌组织MGP表达,利用免疫组织化学EnVision法观察MGP在胃癌中的定位特点.结果 通过对GEO开放数据库内GES4007数据的挖掘分析,发现14个基因表达与胃癌临床病理分期显著相关,其中MGP基因表达升高与临床病理分期呈正相关,对预后有明显影响.定量PCR和Western blot方法证实MGP在胃癌细胞系中存在不同程度表达,免疫组织化学染色显示MGP定位于肿瘤细胞胞质内.RT-PCR分析54例胃癌组织和对应癌旁组织内mRNA,结果显示22例癌组织MGP的mRNA表达明显高于癌旁组织(40.7%).MGP的高表达与胃癌临床病理分期(P=0.001)和预后呈明显相关(P=0.006).结论 公共数据库存储的芯片数据具有再分析价值.MGP基因是与胃癌临床病理分期和预后相关的新型分子标志物.