均匀设计优化杨属的SRAP-PCR反应体系

• 作者: 卫尊征 张金凤 李贤 王欢 郭丽琴 郭军
• 来源期刊: 北京林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 杨属 均匀设计 SRAP-PCR 扩增体系优化
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 林学
• 页码范围: 34-38
• 页数: 5页
• 分类号: S792.11|S718.46
• 语种: 中文

摘要

采用均匀设计方法,对影响杨属SRAP-PCR体系的MgCl_2、dNTPs、引物、TaqDNA聚合酶和模板浓度等因素分别进行了U_(16)(4~5)和U_(12)(3~5)两轮优化,建立了适用于杨属的SRAP-PCR反应体系.在25μL反应体系中,MgCl23.5 mmol/L、dNTPs 0.20 mmoL/L、引物0.44 μmol/L、TaqDNA聚合酶1.50 U、模板浓度28 ng/L为最适条件.在此基础上又对退火温度进行了摸索,结果发现,扩增结果对退火温度变化不敏感.最后运用优化体系对杨属3派10个种共16个单株的DNA进行扩增验证,结果获得的DNA条带清晰,多态性比较丰富.说明这一优化的SRAP-PCR反应体系可用于杨属不同种间亲缘关系、系统进化和遗传多样性等方面的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭军		1	9	1.0	1.0