芥菜型油菜TT1基因的克隆和SNP分析

• 作者: 严明理 刘丽莉 刘忠松 刘显军 官春云 陆赢
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 芥菜型油菜 TT1基因 克隆 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2010,（10）
• 页码范围: 1634-1641
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.01634

摘要

拟南芥的TT1基因(编码含有WIP结构域的锌指蛋白)对种皮的发育和颜色的形成具有重要的调控作用.本研究利用同源克隆和RACE技术分离了芥菜型油菜TT1基因,在芥菜型油菜黄黑籽材料的种皮中进行转录水平的分析,比较了黑籽油菜与黄籽油菜基因序列的差异,并采用等位基因特异(allele-specific)PCR技术对可能存在的单核苷酸多态位点进行验证.结果表明,芥菜犁油菜TT1基因的DNA序列全长为2 197 bp,包含1个内含子,与甘蓝型油菜TT1-1基因的DNA序列的相似性为99%,与拟南芥的TT1基因DNA序列的相似性为85%;推导的TT1蛋白序列为300氨基酸残基,理论分子量为33.97 kD,等电点为6.99;TT1在所有材料的种皮中均检测到表达;比较紫叶芥、四川黄籽、NILA和NILB的TT1基因序列,共发现8个核苷酸变异位点,均在基因的外显子区域,其中紫叶芥和NILA的序列相同,四川黄籽和黑籽近等基因系NILB的序列相同.与紫叶芥相比,黑籽近等基因系NILB有8个核苷酸差异,但种皮颜色与紫叶芥一样,均为黑色,TT1基因这些位点的突变并不影响芥菜型油菜种皮的颜色.通过等位特异PCR可以区分来自四川黄籽与紫叶芥的TT1基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘忠松	湖南农业大学油料作物研究所	76	742	15.0	24.0
2	官春云	湖南农业大学油料作物研究所	326	5059	36.0	51.0
3	刘丽莉	湖南科技大学生命科学学院	44	215	8.0	13.0
4	严明理	湖南科技大学生命科学学院	12	101	6.0	9.0
8	刘显军	湖南农业大学油料作物研究所	14	124	6.0	11.0
9	陆赢	湖南科技大学生命科学学院	1	20	1.0	1.0