软腐病菌诱导的大白菜抑制差减杂交文库构建及分析

• 作者: 屈淑平 崔崇士 曹鸣庆 马荣才
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 软腐病 抑制差减杂交 表达序列标签 大白菜
• 年，卷（期）: 2010,（7）
• 页码范围: 45-51
• 分类号: S634.1|Q78
• 字数: 5178字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-9369.2010.07.009

摘要

利用抑制差减杂交技术构建了软腐欧文氏菌(Erwinia carotovora subsp.carotovora)侵染诱导的结球白菜叶片cDNA文库.文库质量检测表明,差减杂交效率较高,质量较好.随机挑取单克隆进行单向测序,获得1107条长度大于100 bp、质量较好的ESTs序列.利用DNAstar5.0对上述ESTs进行聚类,共获取753个非冗余EST,包括有564个为单拷贝序列(Singletons)和189个重叠群(Contigs).所获得的编码功能已知的EST有508,个,将这些EST进行功能分类,可以看出所代表的基因参与植物体内的各种代谢反应,其中参与初级代谢和能量代谢的最多(33.3%),其次是参与抗病/防卫反应(12.6%)、再次为参与信号传导(11.4%)和蛋白质合成与加工(9.4%),参与细胞的结构与生长发育、物质运输、转录调控等过程的基因相对较少.RT-PCR分析结果表明,MAPK、SA、ROS等信号通路参与软腐病菌诱导的大白菜抗病防卫反应.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	屈淑平	东北农业大学园艺学院	48	516	13.0	20.0
3	崔崇士	东北农业大学园艺学院	119	1485	21.0	30.0
4	曹鸣庆		24	789	12.0	24.0
5	马荣才		27	737	13.0	27.0