基于改进SEM算法的基因调控网络构建方法

• 作者: 姚宏亮 王浩 葛玲玲
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: 基因调控网络 动态贝叶斯网络 贝叶斯结构期望最大化算法
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 算法研究探讨
• 页码范围: 450-452,458
• 页数: 4页
• 分类号: TP181
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2010.02.012

摘要

动态贝叶斯网络(DBN)是基因调控网络的一种有力建模工具.贝叶斯结构期望最大算法(SEM)能较好地处理构建基因调控网络中数据缺失的情况,但SEM算法学习的结果对初始参数设置依赖性强.针对此问题,提出一种改进的SEM算法,通过随机生成一些候选初始值,在经过一次迭代后得到的参数中选择一个最好的初始值作为模型的初始参数值,然后执行基本的SEM算法.利用啤酒酵母细胞周期微阵列表达数据,构建其基因调控网络并与现有文献比较,结果显示该算法进一步提高了调控网络构建的精度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王浩	合肥工业大学计算机与信息学院	193	1473	20.0	29.0
2	姚宏亮	合肥工业大学计算机与信息学院	95	488	11.0	16.0
3	葛玲玲	合肥工业大学计算机与信息学院	4	3	1.0	1.0