拟南芥SSR检测体系的优化

• 作者: 刘宛 周启星 李培军 王磊 钟鸣 高海荣
• 来源期刊: 生态学杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 拟南芥 SSR 体系优化 凝胶电泳
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 401-406
• 页数: 6页
• 分类号: S963
• 语种: 中文

摘要

以拟南芥(Arabidopsis thaliana)幼苗为实验材料,采用单因素筛选法及L_(16)(4~5)正交实验方法,对简单序列重复(SSR)技术中聚合酶链式反应(PCR)组分、扩增程序、电泳检测等环节进行优化.优化25μl反应体系为:1×PCR Buffer、20 ng模板DNA、1.5 mmol·L~(-1) Mg~(2+)、0.3 μmol·L~(-1)引物、150 μmol·L~(-1) dNTPs和1.0 U Taq DNA聚合酶.扩增程序为:94℃预变性5 min,94 ℃变性30 s,57℃退火30 s,72℃延伸45 s,共30个循环,72℃延伸10 min.用非变性聚丙烯酰胺凝胶(EB染色)电泳检测并取得较好效果.利用该体系进行扩增,所得谱带清晰、稳定、非特异性带少.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周启星	中国科学院沈阳应用生态研究所陆地生态过程重点实验室	270	17178	75.0	120.0
2	李培军	中国科学院沈阳应用生态研究所陆地生态过程重点实验室	229	8636	51.0	82.0
3	刘宛	中国科学院沈阳应用生态研究所陆地生态过程重点实验室	45	1478	20.0	38.0
4	钟鸣	沈阳农业大学辽宁省农业生物技术重点实验室	53	379	12.0	17.0
5	王磊	沈阳农业大学辽宁省农业生物技术重点实验室	21	251	7.0	15.0
6	高海荣	沈阳农业大学辽宁省农业生物技术重点实验室	1	3	1.0	1.0