甘蔗SSR和AFLP分子遗传连锁图谱构建

• 作者: Karen Sarah AITKEN Phillip Andrew JACKSON 刘新龙 毛钧 范源洪 蔡青 陆鑫 马丽
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘蔗 遗传连锁图谱 SSR AFLP 群体
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 177-183
• 页数: 7页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.00177

摘要

采用甘蔗商业品种Co419与野生种割手密Y75/1/2杂交,获得269个单株,组成F_1群体,用F_1 02/356与商业品种ROC25回交获得266个单株,组成BCl群体.利用筛选的多态性条带丰富的36对SSR引物和12对AFLP引物,对两个群体进行PCR扩增和分子遗传连锁分析,构建甘蔗分子遗传连锁图谱.用F_1群体获得630个分离标记,经χ~2检测,298个标记为单双剂量标记,占总标记数的47%;用BC_1群体获得571个分离标记,有264个标记为单双剂量标记,占总标记数的46%;4个亲本获得单双剂量标记的数量依次为Co419>02/356>Y75/1/2>Roc25.在LOD≥5.0,相邻标记遗传距离≤40 cM的条件下,F_1群体有134个单双剂量标记被纳入55个连锁群,其中39个连锁群归属8个同源组,16个未列入,总遗传距离为1 458.3 cM,标记间平均图距为10.9 cM;BC_1群体有133个单双剂量标记被纳入47个连锁群,其中34个连锁群归属于8个同源组,13个连锁群未列入,总遗传距离为1 059.6 cM,标记间平均图距为8.0 cM.从4个亲本单双剂量标记进入的连锁群数来看,Co419最多,归入34个连锁群,其次为Y75/1/2,归人20个连锁群,第3为02/356和ROC25,归入19个连锁群.研究结果表明,从单双剂量标记比例、形成连锁群数量、总遗传距离来看,F_1群体构图质量要优于BC_1群体.