黑龙江野鲤核糖体内转录间隔区1(ITS-1)的克隆及二级结构的预测与分析

• 作者: 刘红 张成锋 朱健 李冰 蔡生力 钟立强
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 黑龙江野鲤 内转录间隔区1(ITS-1) 基因克隆 二级结构
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 778-783
• 分类号: S965.116
• 字数: 3320字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2010.04.020

摘要

黑龙江野鲤是中国北方重要的养殖鱼类,分析和了解其遗传结构对鲤鱼种质资源的保护和遗传性状的改良具有重要的意义.该研究对黑龙江野鲤(Cyprinus carpio haematopterus)核糖体内转录间隔区1(ITS-1)进行了克隆测序,并对ITS-1序列进行了分析.结果显示:所克隆的黑龙江野鲤ITS-1序列长度为365 bp,其中A、T、G、C 4种碱基的含量分别为21.4%、12.3%、34.0%和32.3%;与从GenBank中检索到的6种鲤科鱼类的ITS-1序列相比较,相似性较低,介于24.9%至59.5%之间;同时利用最小自由能原理预测7种鲤科鱼类ITS-1序列的二级结构,并分析了其结构特点.根据鲤鱼与其他6种鲤科鱼类的ITS-1序列的同源性构建NJ系统进化树,与根据该保守序列形成的发夹结构的相似性构建的进化树大致相同,所得的分类结果与传统的分类结果基本一致.因此,一、二级结构相结合将是研究物种分子系统学的重要手段.