基于生物信息学分析方法设计HSV-1诊断芯片的通用寡核苷酸探针

• 作者: 崔智威 曾照芳 申崇标
• 来源期刊: 激光杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 单纯疱疹病毒1型 基因芯片 BLAST Oligo探针
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 页码范围: 63-64
• 分类号: R477
• 字数: 2098字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0253-2743.2010.02.037

摘要

目的:设计单纯疱疹病毒1型(HSV-1)诊断芯片的寡核苷酸(Oligo)探针;方法:利用BLAST软件对HSV-1的基因序列进行对比,得出对设计HSV-1探针有意义的特异序列,并通过生物学软件Oligo 6.0设计特异性高Tm值相近、长度均一的Oligo探针;结果:获得在相同的杂交、清洗条件下可得到最佳杂交效果的10条30-mer的Oligo探针;结论:通过生物信息学方法设计出HSV-1诊断芯片的探针,可为后期制备成基因芯片,为进行HSV-1的检测打下良好的基础.