基于rDNA-ITS序列探讨甘蔗近缘属种的系统进化关系

• 作者: 刘新龙 应雄美 苏火生 范源洪 蔡青 陆鑫 马丽
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘蔗 ITS 系统进化 甘蔗亚族
• 年，卷（期）: 2010,（11）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1853-1863
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.01853

摘要

以狼尾草属(Pennisetum Rich.)的象草(P.purpureum)为外群体,依据rDNA-ITS 序列探讨了甘蔗亚族(Saccharinae)内与甘蔗植物分类关系较近的8属37种120份材料的系统进化关系,结果表明,ITS1 序列长度为200～208 bp,变异位点91个,简约信息位点70个,GC含量为60.4%～69.1%;ITS2序列长度为215～220 bp,变异位点93个,简约信息位点68个,GC含量为66.1%～73-4%;5.8sDNA序列长度为164 bp,变异位点18个,简约信息位点9个,GC含量为54.1%～58.0%;根据变异位点,简约信息位点占总位点的比例可以看出,ITS序列比5.8sDNA序列变异程度高,其中ITS1序列又较ITS2序列变异丰富.属种问遗传距离表明芒属(Miscanthus)和荻属(Triarrhena)与甘蔗属(Saccharum)的亲缘关系最近,其次为蔗茅属(Erianthus)和河八王属(Narenga);而莠竹属(Microstegium)、大油芒属(spodiopogon)、白茅属(1mperata)与甘蔗属亲缘关系较远.根据甘蔗近缘属种的NJ和MP系统发育关系,支持将斑茅(E.arundinaceus)归入蔗茅属,荻属归入芒属的观点;河八王属的河八王(N.porphyrocoma)与滇蔗茅(E.rockii)亲缘关系较近,而与同属的金猫尾(N.fallax)亲缘关系较远;蔗茅属和芒属属种系统进化关系较其他属种复杂;有4份材料被发现鉴定有误,不应用于后续研究.