绵羊MC4R基因的半定量RT-PCR及生物信息学分析

• 作者: 张菊 李宏滨 杜立新 魏彩虹
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 黑素皮质素受体-4 基因克隆 半定量RT-PCR 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（7）
• 页码范围: 804-810
• 分类号: S826|S813.1
• 字数: 4579字
• 语种: 中文

摘要

本研究旨在对绵羊MC4R基因进行组织表达谱和生物信息学分析.参考牛MC4R基因序列设计引物,采用PCR技术克隆绵羊MC4R基因序列,并利用半定量RT-PCR进行组织表达谱分析;同时对其进行生物信息学分析.结果表明,克隆的绵羊MC4R基因全长1 919 bp,含有999 bp的完整CDS编码区,编码332个氨基酸.其CDS编码区的核苷酸序列与牛、人、猪、大鼠、小鼠MC4R基因对应序列的同源性分别为95.2%、68.8%、82.7%、76.6%、77.1%,预测的氨基酸序列同源性分别为97.0%、92.8%、93.7%、92.2%、91.6%.组织表达谱分析表明MC4R基因在各组织均不同程度的表达,其中在大脑表达量很高,其他组织较低.生物信息学预测MC4R蛋白功能发现,绵羊的MC4R蛋白存在7个跨膜螺旋结构域,同时预测MC4R存在10个磷酸化位点和1个特异性蛋白激酶磷酸化位点.结果表明,MC4R是一个非常保守的蛋白,在绵羊的生长发育中起着重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜立新	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所国家畜禽分子遗传育种中心	110	1652	21.0	37.0
2	李宏滨	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所国家畜禽分子遗传育种中心	39	938	18.0	30.0
3	魏彩虹	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所国家畜禽分子遗传育种中心	23	92	7.0	9.0
4	张菊	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所国家畜禽分子遗传育种中心	3	22	2.0	3.0