干旱胁迫下棉花SSH文库构建及其抗旱相关基因分析

• 作者: 叶武威 宋丽艳 崔宇鹏 樊伟丽 王俊娟 王德龙
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 干旱胁迫 SSH unigene 耐旱
• 年，卷（期）: 2010,（12）
• 页码范围: 2035-2044
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.02035

摘要

以耐旱自交系邯郸177为材料,利用抑制性差减杂交技术(SSH),构建棉花苗期叶片的正向差减文库.挑取300个阳性克隆进行PCR验证,并对验证后的单克隆进行测序和分析,共获得284个有效序列.聚类后得到202条uniESTs序列,其中174条singlets,28条contigs.经过BlastN分析,156个unigene可以在GenBank中找到同源序列,46个unigene未能找到同源匹配.经BlastX分析,40个unigene与未知功能蛋白或假定蛋白有较高相似性,116条unigene与已知功能蛋白有较高同源性.用KOBAS系统将33个unigene定位到55个Pathways中,其中P值小于0.5的Pathway有23条.初步分析发现,丙酮酸盐代谢(pyruvate metabolism)途径、乙醛酸和二羧酸代谢(glyoxylate and dicarboxylate metabolism)途径与棉花抗旱相关性较大.这些unigene基因涉及信号传导、能量代谢、蛋白质代谢、核酸代谢、光合作用及膜运输等代谢过程.发现了苹果酸合成酶基因(Ms1,001_B03;Ms2,003_E04)、苹果酸脱氢酶基因(Md1,001_C12;Md2,002_F01);NAC(001_C08)、锌指蛋白(zfp,003_C06)、BZR1/BES1(003_G04)等转录调节因子,以及翻译控制肿瘤蛋白基因(TCTP,002_C04)等耐旱相关基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔宇鹏		1	27	1.0	1.0