陆地棉突变体腺体形成时期的基因表达谱

• 作者: 伍婷玉 何晓红 孙全 张锐 朱小燕 江怀仲 江明锋 潘正 王玲 石玉真 莫剑川 蔡应繁 袁友禄 谢永芳 陈敏 陈珺 高运玲
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 棉酚 腺体形成 基因芯片 表达谱
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·耕作栽培·生理生化
• 页码范围: 476-481
• 分类号: S562.01
• 字数: 3996字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2010.03.005

摘要

为了解棉花腺体形成时期相关基因的表达谱,分别抽提陆地棉湘棉-18和N5在腺体形成时期的RNA,采用Affymetrix芯片,扫描采集数据后进行分析.结果显示,在腺体形成时期有明显差异表达的基因共有514条,包括209条上调基因和305条下调基因;在514条差异表达基因中有275条(53.5%) 与GenBank中已知的基因具有较高的相似性,这些基因主要涉及防御反应及异戊二烯生物合成等,有239条(46.5%)在GenBank中无任何注释.KOBAS分析结果显示,这些差异基因在KEGG数据库上涉及19条生化途径.说明,腺体形成过程是一个复杂的基因网络调控过程,涉及多条萜类化合物生物合成途径及其他与防御基因相关的途径.