不同统计遗传模型QTL定位方法应用效果的模拟比较

• 作者: 盖钧镒 苏成付 赵团结
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: QTL定位 遗传模型 定位程序 定位方法与数据模型的适配性
• 年，卷（期）: 2010,（7）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1100-1107
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.01100

摘要

分子遗传和数量遗传的结合,发展了QTL定位研究.随着定位方法与软件的建立和完善,QTL定位的研究越来越多.准确定位的QTL可用于分子标记辅助选择和图位克隆,而假阳性QTL将误导定位信息的应用.本文分析了迄今主要定位方法(软件)对于各种遗传模型数据的适用性.应用计算机模拟4类遗传模型不同的重组自交系群体(RIL),第一类只包含加性QTL;第二类包含加性和上位性互作QTL;第三类包含加性QTL和QTL与环境互作效应;第四类包含加性、上位性互作QTL和QTL与环境互作效应.每类按模拟QTL个数不同设两种情况,共分为8种数据模型(下称M-1～M-8).选用WinQTLCart 2.5的复合区间作图(下称CIM)、多区间作图前进搜索(MIMF)、多区间作图回归前进选择(MIMR)、IciMapping 2.0的完备复合区间作图(ICIM)、MapQTL 5.0的多QTL模型(MQM)以及QTL network 2.0的区间作图(MCIM)6种程序对8种不同遗传模型的RIL进行QTL检测.结果表明,不同程序适用的遗传模型范围不同.CIM和MQM只适于检测第一类模型;MIMR、MIMF和ICIM只适于检测第一类和第二类模型;只有MCIM适于检测所有4类遗传模型;因而不同遗传模型数据的最适合检测程序不同.由于未知实际数据的遗传模型,应采用在复杂模型程序,如QTLnetwork 2.0,扫描基础上的多模型QTL定位策略,对所获模型用相应模型软件进行验证.