西施舌5个地理群体ITS1序列变异及系统发生分析

• 作者: 孟学平 王帅 申欣 程汉良 董志国 阎斌伦 高如承
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 西施舌 ITSI 序列分析
• 年，卷（期）: 2010,（20）
• 页码范围: 5555-5561
• 分类号: TP3
• 语种: 中文

摘要

利用核糖体rRNA基因第一内转录间隔区(ITS1)序列,对我国山东日照(RZ)、江苏连云港(LYG)和启东(QD)、福建长乐(CL)、广西北海(BH)沿海西施舌5个野生群体的遗传结构进行了分析.经PCR扩增、克隆、非克隆测序,获得长度为816-843bp的ITS1核苷酸序列,其平均G+C含量(60.8%)显著高于A+T含量.在西施舌5个群体93个个体118个序列中共检测到153个变异位点,多态位点比例为18.3%,其中,简约信息位点为63个,共有63种基因型.群体间遗传距离在0.74%-3.38%之间,群体内遗传距离为0.72%-1.06%之间.CL群体与其他4个群体间的遗传距离明显高(3.17%-3.38%).AMOVA分析结果显示长乐群体有明显的遗传分化(FST=0.670-0.702,P＜0.001).以中国蛤蜊为外群构建的NJ树和ML树显示CL群体聚为一支,非长乐群体互相重叠聚为另一支,研究结果显示,长乐群体已经形成了具有明显遗传结构的地理种群.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	申欣	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点实验室	37	175	8.0	11.0
2	孟学平	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点实验室	46	339	11.0	15.0
3	程汉良	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点实验室	62	727	14.0	24.0
4	董志国	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点实验室	38	484	14.0	21.0
5	高如承	福建师范大学生命科学学院	49	388	13.0	17.0
6	王帅	福建师范大学生命科学学院	12	59	3.0	7.0