大豆BAC克隆基因注释

• 作者: 王囡囡
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆BAC克隆 序列比对 基因注释
• 年，卷（期）: 2010,（12）
• 页码范围: 110-112,117
• 分类号: S5
• 字数: 2191字
• 语种: 中文

摘要

根据来源于大豆BAC克隆库中的基因组序列,与其比对的基因或蛋白质序列可以从一些数据库中搜索,如GenBank序列数据库、EMBL数据库、PDB数据库等,然后利用NCBI的Entrz程序在数据库中搜索大豆基因类似物,获取其登录号及核苷酸序列,以及这些基因编码的氨基酸序列,通过GENSCAN等软件分析,得出的是与拟南芥等物种序列比对的结果,根据GENSCAN的预测结果,可以初步得知序列长度、基因数目及具有编码某种功能蛋白的基因存在的可能性,进而对预测出的氨基酸或核苷酸序列利用数据库NCBI中的BLAST进行序列的相似性搜索及比对分析,寻找其保守区域.最后对其功能基因进行注释.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王囡囡		33	165	7.0	11.0