三峡库区上、下游血吸虫病流行区钉螺线粒体cox1基因遗传变异研究

• 作者: 何谐 张锡林 牛慧 王利芳 陈琳
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 湖北钉螺 线粒体DNA 细胞色素C氧化酶亚单位Ⅰ基因 遗传多态性
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 所属期刊栏目: 硕博专栏论著
• 页码范围: 5-8,封2
• 页数: 5页
• 分类号: R532.21
• 语种: 中文

摘要

目的 研究三峡库区上、下游血吸虫病流行区钉螺线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚单位1(cox1)基因的遗传变异.方法 采集三峡库区上游四川、云南及下游安徽、湖北4省共7个地、市的钉螺样本,提取基因组DNA,PCR特异性扩增线粒体cox1基因并测序,用ClustalX(1.81)软件进行多序列比对,MEGA(4.0)软件Kimura2-parameter法计算遗传距离,邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建系统发生树.结果 上游与下游不同地域株钉螺问cox1基因差异约为16%,下游地区的肋壳与光壳钉螺cox1基因差异约为3.7%,上游不同地域株钉螺碱基差异约为5.4%.遗传距离显示,上游四川与云南地域株的遗传距离为0.022～0.050,下游安徽与湖北地域株的遗传距离为0.014～0.027,而上游与下游各地区螺群间的遗传距离在0.127～0.138之间,明显大于上游或下游各地区螺群内的遗传距离.进化树结果表明,下游湖北的荆州、石首和安徽的芜湖、宁国钉螺形成一支系,上游四川的绵竹、新都钉螺同属一支系,但两种方法构建的进化树在云南大理钉螺的归属上存在差异,MP法提示大理钉螺从上游的分支中独立出来,单独形成一类.结论 上游与下游不同地域株钉螺cox1基因遗传差异较显著,下游肋壳和光壳钉螺种群内遗传变异较小,而上游光壳钉螺种群内遗传变异较大.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张锡林	第三军医大学基础部病原生物学教研室	117	382	10.0	12.0
2	陈琳	第三军医大学基础部病原生物学教研室	40	266	10.0	15.0
3	何谐	第三军医大学基础部病原生物学教研室	7	26	3.0	4.0
4	王利芳	泸州医学院病原生物学教研室	4	20	3.0	4.0
5	牛慧	泸州医学院病原生物学教研室	3	13	2.0	3.0