新疆沙湾冷泉沉积物的细菌系统发育多样性

• 作者: 吴江超 娄恺 孙建 张涛 徐建华 曾军 杨红梅
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 冷泉 地下水生态系统 细菌多样性 免培养法
• 年，卷（期）: 2010,（21）
• 页码范围: 5728-5735
• 分类号: Q93
• 语种: 中文

摘要

为了解新疆沙湾冷泉沉积物的细菌群落组成与类群多样性,利用免培养方法直接从沙湾冷泉沉积物中提取环境总DNA,构建细菌16S rRNA基因文库.对随机挑选的241个细菌阳性克隆子进行Hae Ⅲ酶切分型得到86个可操作分类单元(OTUs),系统发育分析将其归为11个门:放线菌门(Actinobacteria),酸杆菌门(Acidobacteria),拟杆菌门(Bacteroidetes),绿菌门(Chlorobi),蓝细菌门(Cyanobacteria),厚壁菌门(Firmicutes),芽单胞菌门(Gemmatimonadetes),硝化螺旋菌门(Nitrospirae),变形菌门(Proteobacteria),浮霉菌门(Planctomycetes),疣微菌门(Verrucomicrobia).其中酸杆菌门和变型菌门为优势类群,分别占细菌克隆文库的48%和25%.超过1/3的OTUs序列与GenBank中已存序列具有较低相似性(相似性小于95%).此外20%左右的克隆子与固氮细菌和硝酸盐氧化细菌相关.研究结果表明,新疆沙湾冷泉沉积物中细菌种类丰富,代谢类型多样而且存在大量未知类群.