中国狂犬病病毒遗传多样性分析

• 作者: 严家新 吴杰 周敦金 孟胜利 徐葛林 明贺田 朱风才 杨晓明 王定明 程满荣 舒祥 雷勇良
• 来源期刊: 中国生物制品学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 狂犬病病毒 遗传多样性 分子流行病 N基因
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 449-454
• 分类号: R373.9|Q789
• 语种: 中文

摘要

目的 分析中国狂犬病病毒(RV)的遗传多样性,为我国狂犬病的预防提供理论依据.方法 采用RT-PCR技术扩增26株RV N基因,并进行测序,与GenBank登录的序列进行比对,构建进化树,分析RV的基因分型和分组情况以及时间和空间的动态进化.结果 中国RV分为2个大的进化分支(8组),分支Ⅰ包括1～4组,分支Ⅱ包括5～8组,组内核苷酸同源性≥93.2%,氨基酸同源性≥94.3%;组间核苷酸差异性≥8.0%,氨基酸差异性≥1.7%;运用贝叶斯中的马尔科夫链的蒙特卡洛方法,估计中国RV N基因核苷酸的平均碱基替代率为1.408 9×10-4取代/位点·年,共同祖先出现在公元968年.结论 中国狂犬病病毒株均属于基因1型狂犬病病毒,存在跨地域、跨宿主传播;我国分支Ⅰ狂犬病病毒株与泰国、越南、菲律宾、印度尼西亚、马来西亚等东南亚国家分离的狂犬病病毒株起源相同;分支Ⅱ的毒株在全球分布.