安庆市人与猪群中戊型肝炎病毒的系统进化分析

• 作者: 刘海燕 夏玉刚 胡安群 郑英杰 陆一涵
• 来源期刊: 中华预防医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肝炎病毒,戊型 基因型 进化 序列分析
• 年，卷（期）: 2010,（10）
• 页码范围: 888-892
• 分类号: R1
• 字数: 3209字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2010.10.010

摘要

目的 了解安庆市人与猪群中流行的戊型肝炎病毒(hepatitis E Virus,HEV)的基因型和系统进化特征.方法 收集安庆市27份散发戊型肝炎患者血清标本和400份商品猪胆汁标本,并根据采样时间将猪胆汁标本分为A、B、C、D等4组(每组各100份).应用巢氏逆转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)方法检测HEV开放式阅读框架(open reading frame,ORF)2区域内150 nt序列,测序后与GenBank下载的参考病毒株序列进行比对,并计算核苷酸序列间的同源性.使用贝叶斯推断法构建系统进化树,分析安庆市人与猪群中HEV的基因型和系统进化关系.结果 患者的男女性别比例为2.86∶1,平均年龄为56.78岁.27份患者血清标本中有16份检出HEV RNA,阳性检出率为59.26%.安庆市人HEV病毒株与基因Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为74.75%～82.99%、75.26%～83.64%、72.77%～80.57%和88.03%～91.63%.400份猪胆汁中有22份(5.5%)分离出HEV RNA,A、B、C、D各组的HEV携带率分别为7.00%、3.00%、9.00%、3.00%,各组间的猪HEV携带率差异无统计学意义(x2=5.20,P=0.16).安庆市猪HEV病毒株与基因Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为75.24%～83.42%、75.93%～84.19%、72.86%～80.64%和88.15%～91.79%.系统进化树分析结果显示,安庆市人和猪HEV病毒株均属于基因Ⅳ型,且错落分布于进化分支上,无明显的物种聚集现象.结论 基因Ⅳ型HEV为安庆市人和猪的优势病毒株,且有可能在该地区人和猪群中跨物种传播.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡安群		10	45	4.0	6.0
2	刘海燕		7	40	3.0	6.0