新城疫病毒云南分离株F基因变异特性分析

• 作者: 冯子良 叶丛华 吕粤 宋建领 岳亮 张富强 张应国 张思东 张文东 王金萍 田建国 范泉水 赵焕云 邱薇
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 新城疫病毒 F基因 序列分析 基因型
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 14-18
• 分类号: S852.659.5
• 字数: 3038字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2010.05.004

摘要

采用RT-PCR技术对云南2007年-2009年采集的948份喉气管拭子或组织样品中新城疫病毒F基因进行检测,获得阳性样品65份,选择30份代表性阳性样品采用特异性引物经RT-PCR扩增F基因,纯化后克隆至pMD18-T载体,并对其进行测序.序列比对及系统发育分析结果表明,新城疫病毒云南分离株F基因核苷酸与疫苗LaSota株之间的同源性为70.5%～99.8%,与F48E9株之间的同源性为70.7%～90.8%.系统发育分析表明,30株病毒中21株属于基因型Ⅶ,裂解位点氨基酸为R-R-Q-K-R-F,与传统认为强毒裂解位点氨基酸序列相同;7株属于基因型Ⅱ,5株裂解位点氨基酸为G-R-Q-G-R-L,属于弱毒株裂解位点氨基酸排列特征,2株裂解位点氨基酸为R-R-Q-K-R-F属于强毒裂解位点氨基酸序列;2株病毒与9个基因型的同源性差异较远.