基于多特征尺度的大肠杆菌启动子预测

• 作者: 杨乌日吐 林昊
• 来源期刊: 计算机工程与科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 大肠杆菌启动子 位置关联打分函数 多样性指标 修正的马氏判别式
• 年，卷（期）: 2010,（9）
• 页码范围: 148-151
• 分类号: Q61
• 字数: 3672字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-130X.2010.09.039

摘要

本文对实验证实的741条大肠杆菌Sigma70启动子的序列进行预测研究.首先,基于RNA聚合酶与DNA的相互作用,利用位置打分函数对序列中的保守位点进行了衡量;然后,根据启动子的序列特征,利用离散性指标对序列中不同的碱基信息含量进行测量;最后,利用多元非线性判别分析实现了对大肠杆菌启动子的预测.10折叠交叉检验结果显示,总体预测精度达到85%以上.与其它算法比较结果显示,我们开发的这一算法能够更好地预测大肠杆菌启动子.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨乌日吐	内蒙古大学研究生工作部	8	18	3.0	4.0
2	林昊	电子科技大学生命科学与技术学院	10	13	2.0	2.0