蛋白质Cα原子接触数的数字特征分析

• 作者: 范宁
• 来源期刊: 数字技术与应用
• 学科: 地球科学
• 关键词: 蛋白质 Cα原子 平均接触数 数字特征
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 所属期刊栏目: 学术论坛
• 页码范围: 91-93
• 分类号: P963
• 字数: 2716字
• 语种: 中文

摘要

Cα是蛋白质分子中的重要原子,是蛋白质折叠和设计中的重要研究对象.本文根据α-氨基酸和Cα原子的理化特性,引入接触数的概念,从数字特征方面研究蛋白质中Cα原子空间拓扑结构.主要利用结构规律统计与计算机模拟手段,对1653个蛋白质PDB进行了处理分析,对Cα原子数目所占比例、Cα原子平均接触数、接触数变化率进行了讨论.最后以1EXS为例加以说明,其中多于65%的Cα原子间距大于3个原子单位,平均接触敏变化率在4-10之间波动较大,且Cα原子分布不均匀.本文是关于生物、统计学科结合的研究,在数字表征,数据挖掘层面上,分析了Cα原子,为人工组合蛋白质提供了数字支持;同时也对氨基酸理化特性指出了以Cα原子为基准的新方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	范宁	武汉理工大学理学院统计学系	2	4	1.0	2.0