利用SSH技术鉴定黄瓜胚胎发育相关基因

• 作者: 周秀艳 武涛 盛慧 秦智伟
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜 SSH 胚胎发育 cDNA文库
• 年，卷（期）: 2010,（11）
• 页码范围: 2292-2299
• 分类号: S6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2010.11.012

摘要

[目的]寻找黄瓜胚胎发育早期和胚胎发育晚期优势表达基因,研究其胚胎发育的分子机制.[方法]利用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建胚胎发育早期和晚期差异表达cDNA文库.[结果]经反向Northern blot杂交检测,共得到97个阳性克隆.利用分子生物学软件对测序后的序列进行质量检测和聚类、拼接,共得到93个UniESTs,其中包括86个Singletons和7个contigs.将上述EST序列在GenBank上进行BLAST比对,有83个EST片段找到了与之匹配的同源序列,有10个EST片段未找到同源序列,推测可能是新基因.[结论]其中很多EST与拟南芥、水稻或玉米蛋白质数据库中的热激蛋白具有很高的同源性.将以上序列应用Geneontology进行功能分类,发现在胚胎发育早期细胞防御和代谢过程占主要位置;在胚胎发育晚期细胞防御和抗渗透胁迫功能是非常重要的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周秀艳	东北农业大学园艺学院黄瓜分子育种实验室	111	1188	17.0	28.0
2	秦智伟	东北农业大学园艺学院黄瓜分子育种实验室	170	2065	23.0	34.0
3	武涛	东北农业大学园艺学院黄瓜分子育种实验室	28	274	9.0	16.0
4	盛慧	东北农业大学园艺学院黄瓜分子育种实验室	4	51	3.0	4.0