香菇EST资源的SSR信息分析

• 作者: 于晓飞 刘林德 周瑞莲 王爱云 王艳芳 王芹芹 赵彦宏
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 农学
• 关键词: 香菇 SSR EST 引物
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 137-140
• 页数: 4页
• 分类号: S646.1
• 字数: 2960字
• 语种: 中文

摘要

对来源于NCBI公共数据库的12144条香菇(Lentinus edodes)EST序列进行简单重复序列SSR搜索.结果表明:在这些香菇EST序列中共有359个SSR位点,46种SSR的重复单元,其中2碱基重复243条(67.69%),3碱基重复114条(31.76%),5碱基重复1条(0.28%),6碱基重复1条(0.28%).平均33.8条EST序列中有1个SSR.SSR的碱基总数达7727kb,约占整个EST序列碱基数的2.94%.本实验还根据搜索结果设计了100条香菇EST-SSR引物,并随机合成了20对引物.以4个野外采集的香菇DNA为模板,对引物进行了筛选与评价,有16对引物有较清晰且稳定的目标扩增产物,其中11对引物的产物存在遗传多态性.结果表明本实验设计开发的香菇的EST-SSR标记是可行且有效的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王爱云	鲁东大学生命科学学院	13	66	5.0	8.0
2	赵彦宏	鲁东大学生命科学学院	32	336	9.0	17.0
3	刘林德	鲁东大学生命科学学院	94	722	14.0	22.0
4	王芹芹	鲁东大学生命科学学院	18	60	4.0	7.0
5	王艳芳	鲁东大学生命科学学院	17	103	7.0	9.0
6	周瑞莲	鲁东大学生命科学学院	90	1008	17.0	27.0
7	于晓飞	鲁东大学生命科学学院	1	9	1.0	1.0