大白菜EST-SSR反应体系优化及引物筛选

• 作者: 佟海申 宋希云 宋琳 张志刚 李巧云 赵智中
• 来源期刊: 科技导报
• 学科: 农学
• 关键词: 大白菜 EST-SSR 正交设计 体系优化 引物筛选
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 76-81
• 页数: 6页
• 分类号: S634.1
• 字数: 4769字
• 语种: 中文

摘要

探讨了大白菜EST-SSR反应体系的优化,利用优化的体系筛选部分引物.采用L_(16)(4~4)正交设计,研究各主要参数的适宜浓度,建立适合大白菜EST-SSR反应的最佳体系.结果表明,各因素不同水平浓度对扩增结果均有一定影响,其中以引物浓度影响最大,其次是dNTP和Taq DNA聚合酶,最小是模板DNA用量.优化后的最佳体系(20μL)为:引物浓度1.0μmol/L,dNTPs0.25mmol/L,Taq酶0.5U,模板DNA 70ng.利用优化的体系,根据大白菜EST序列设计引物126对,分别以2对抗、感病毒病的大白菜材料的基因组DNA为模板进行扩增,筛选出至少在一份材料中扩出多态性的引物19对.该优化体系可用于大白菜EST-SSR扩增,初步筛选的引物可用于大白菜病毒病分子标记的进一步研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋希云	青岛农业大学生命科学学院	79	363	11.0	14.0
2	宋琳	青岛农业大学生命科学学院	7	78	3.0	7.0
3	张志刚		2	27	2.0	2.0
4	赵智中		2	40	2.0	2.0
5	佟海申	青岛农业大学生命科学学院	1	13	1.0	1.0