联合分析HCV种属信息区和高度保守区序列确定广东地区HCV基因型和亚型

• 作者: 侯金林 刘叔文 吴英松 周元平 彭劼 曾艳丽 杨洁 魏君锋 黄辉红 黎诚耀
• 来源期刊: 广东医学
• 学科: 医学
• 关键词: 丙型肝炎病毒 基因型 亚型 系统进化树分析
• 年，卷（期）: 2010,（7）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 825-828
• 页数: 4页
• 分类号: R4
• 字数: 2867字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-9448.2010.07.010

摘要

目的 扩增HCV种属信息区NS5B和高度保守区5-UTR基因序列,用系统进化树法深入分析HCV基因型和亚型,阐明广东地区丙型肝炎患者HCV基因型和基因亚型的特点.方法 采集99例慢性丙型肝炎病例血清,应用RT-PCR技术分别扩增HCV NS5B区和5-UTR特定片段,测序后进行系统进化树分析,确定HCV基因型及亚型.结果 99例患者标本均准确分型,其中NS5B区段分型74例,5-UTR区段分型99例.HCV基因型和亚型的分布:1a亚型1例、1b亚型59例、1型7例、2a亚型11例、3a亚型3例、3b亚型2例、3型3例、6a亚型13例;另有2例标本在两区段分型不同,5-UTR /NS5B区段分型分别为6a/1b和3a/1b.两区段共同分型74例,72例标本在两区段基因型一致,2例标本在两区段基因型不同,为HCV重组体.结论 联合分析HCV不同区段基因序列,可提高HCV基因分型的准确度及灵敏性.广东地区慢性丙型肝炎患者HCV基因亚型分布以1b为主;其次为6a和2a;3型中的a、b亚型也占有一定比例.