基于蚁群优化聚类算法的DNA序列分类方法

• 作者: 梁冰 陈德运
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: DNA序列分析 蚁群聚类算法 分类 特征提取 person相关系数
• 年，卷（期）: 2010,（25）
• 页码范围: 124-126,130
• 分类号: TP311
• 字数: 5190字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.2010.25.037

摘要

针对目前聚类算法在分析DNA序列数据时的低效性和分类精度低问题,提出一种基于蚁群优化聚类算法(ACOC)的DNA序列分类方法,在密度函数中加入自适应感应量并应用模拟退火中的α-适应量的冷却策略,采用DNA序列分布特征时DNA序列进行特征提取,并将pearson相关系数引入蚁群聚类算法作为相似性度量.在EMBL-DNA数据库中4个数据集上进行性能测试,与统计聚类和k-means算法的比较表明,该方法具有一定的时间和精度的优越性,适于解决大规模DNA序列数据分类问题.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈德运	哈尔滨理工大学计算机科学与技术学院	143	1570	22.0	31.0
2	梁冰	哈尔滨理工大学计算机科学与技术学院	7	105	5.0	7.0