InsPecT的2种并行优化方案

• 作者: 涂强 迟学斌 郎显宇 陆忠华
• 来源期刊: 计算机工程
• 学科: 地球科学
• 关键词: 蛋白质翻译后修饰 InsPecT软件 盲搜索 对等模式 主从模式
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 所属期刊栏目: 软件技术与数据库
• 页码范围: 100-101,104
• 页数: 3页
• 分类号: N945.15
• 字数: 2538字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3428.2010.06.033

摘要

InsPecT软件能通过盲搜索对蛋白质翻译后修饰进行鉴定,但其计算时间和复杂度较高.针对该问题分别采用对等模式和主从模式实现2种并行优化方案.比较结果表明,以主从模式并行的InsPecT软件通过动态数据分配和主从处理器间的及时响应,维持了更优的负载平衡,其加速效果较明显.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	迟学斌	中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心	101	634	14.0	21.0
2	陆忠华	中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心	55	174	7.0	11.0
3	郎显宇	中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心	7	36	3.0	6.0
4	涂强	中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心	3	4	2.0	2.0