高通量测序及读序映射算法的应用

• 作者: 何风 吴晓明 李慧丽 杨航 郑焱
• 来源期刊: 生物医学
• 学科: 医学
• 关键词: 蛋白质DNA相互作用 CHIP-SEQ 基因组 读序映射
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: R73

摘要

免疫共沉淀-DNA高通量测序二者的结合是研究蛋白质与基因组DNA相互作用及组蛋白修饰的新实验工具,它同时也对短DNA读序在基因组上的映射、映射结果比较提出了新的算法需求。本文介绍新一代测序原理及数据的特点、相关的读序映射算法的基本原理及对应软件,并说明了该方法在组蛋白修饰、转录因子结合位点分析中的应用。